Nedostatak tinte u boji je taj što nije vodootporna, a budući da se molekule boje brzo razgrađuju pod ultraljubičastim zračenjem, očito će izblijedjeti u roku od mjesec dana nakon korištenja na otvorenom pod ultraljubičastim zračenjem.
Nedostatak je što će većina pigmentnih tinti uzrokovati ostatke materijala u boji na površini. Stoga ni ispis na sjajni papir i drugi papir s ravnom površinom ne može ispisati sjajne slike, zbog čega stvari otisnute pigmentnim tintama uglavnom nemaju sjaja. Osim toga, proizvodni troškovi pigmentne tinte su veći, tako da je prodajna cijena također viša od one tinte u boji, a razlika u cijeni je više od dva do četiri puta.
